Analyse des réponses biologiques au regard de la qualité des cours d'eau bretons

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Type d'offre : Stage
Localisation : Bretagne
Société : Office Français de la Biodiversité (OFB)
Date limite de candidature : 19/12/2024 (publiée le 19/11/2024)

Présentation de l'offre

Mission

Ce stage a pour objet l’analyse des réponses des communautés de macro invertébrés aquatiques et de diatomées de Bretagne aux pressions de la qualité de l’eau.

Activités principales

Utiliser les jeux de données proposés pour effectuer des analyses des listes biologiques en fonction des pressions de qualité d'eau identifiées dans le cadre du calcul de l'état des eaux  (Directive Cadre sur l'Eau DCE).
Les données utilisées seront issues du réseau de stations de la DCE. 

Contenu du stage :

• Affiner le périmètre de l’étude : choix des stations ayant des données biologiques disponibles (macro invertébrés et diatomées) pour la période de 2008 à 2023 (Réseaux DCE RCS et RCO) ;
• Analyser les réponses biologiques aux pressions sur la qualité d’eau (notamment nutriments et matières organiques) à différentes échelles : indice invertébrés multimétrique (I2M2), indice biologique diatomées (IBD), métriques issues de l’I2M2 et de son outil diagnostic associé, variabilités taxonomiques ;
• Ces premiers éléments permettront d’affiner territorialement les diagnostics écologiques émis par la surveillance de la DCE, et émettre des hypothèses sur l’expression des pressions en nutriments au sein de l’écologie des cours d’eau bretons et les confronter aux pressions identifiées lors de l’état des lieux DCE, en s’aidant les hypothèses formulées lors d’études précédentes ([2], [3], [4]). D’autres études pourront également être mobilisées ;
• D’autres éléments devront être mobilisés en fonction de l’avancée du stage : morphologie, taille du bassin versant, autres analyses physico chimiques et pesticides.

L’OFB dispose à cet effet de plusieurs jeux de données :

• Des échantillonnages pluri-annuels des macro invertébrés et diatomées sur un réseau de stations en rivière (réseau DCE) ;
• Le réseau hydrographique et la délimitation des bassins versants ;
• Des analyses physico chimiques sur le même réseau de stations que pour l’hydrobiologie ;
• L’ensemble des analyses et documents produits durant le stage respectera les principes de reproductibilité et d’ouverture du code comme des données [1].

Conditions d'exercice / sujétions particulières

Poste basé à Cesson-Sévigné (35), travail de bureau à la direction régionale de l’OFB ou en télétravail. Déplacements sur des opérations de prélèvements hydrobiologiques en région Bretagne.

Profil recherché

Niveau bac +5 / Master / Ingénieur / Césure.

Connaissances :

• Statistiques et modélisation ;
• Écologie aquatique ;
• Utilisation du logiciel R ;
• Dynamique de population ;
• Utilisation de forge logicielle (ex : Github).

Savoir-faire opérationnel :

• Faire preuve de curiosité et d'ouverture d'esprit ;
• Avoir le sens de l’initiative ;
• Faire preuve de créativité ;
• Agir avec rigueur et organisation.

Savoir-être professionnel :

• Curiosité, ouverture d’esprit ;
• Sens de l’initiative ;
• Créativité ;
• Rigueur et organisation.

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