Echantillonnage et évaluation de l'état écologique des cours d'eau intermittents H/F

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Type d'offre : Stage (4 à 6 mois)
Localisation : Rhône-Alpes
Société : Office Français de la Biodiversité (OFB)
Date limite de candidature : 26/12/2024 (publiée le 28/11/2024)

Présentation de l'offre

Dans le cadre des réseaux de suivi de l’état écologique des cours d’eau répondant aux exigences de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE), un certain nombre de stations subissent chaque année des épisodes d’assecs, qui pour une part au moins tendent à devenir plus fréquents et/ou plus précoces et/ou plus durables. 
La typologie des masses d’eau est basée sur des caractéristiques naturelles (relief, géologie, climat, géochimie des eaux, débit...) qui ont une influence structurante sur la répartition géographique des organismes biologiques.

La répartition des cours d’eau présentant des périodes d’assecs sur le territoire et leur diversité, notamment quant à l’origine des assecs, a rendu jusqu’ici difficile, pour ne pas dire impossible, l’identification et la caractérisation d’un type à part entière dans l’application de la DCE. Ainsi globalement, les méthodes d’échantillonnage, basées sur les protocoles des cours d’eau « pérennes », et surtout les outils d’évaluation (indicateurs, métriques) sont assez peu spécifiques, même si les périodes d’échantillonnage sont adaptées au cas par cas (plus tôt dans l’année) et que certaines stations peuvent bénéficier des ajustements (voire d’exceptions) typologiques lorsque leurs caractéristiques se rapprochent de certains types existants (ex cours d’eau Méditerranéens). 
Or les cours d’eau intermittents font l’objet depuis plusieurs années d’études et de suivis scientifiques spécifiques montrant toute l’originalité de leur fonctionnement et de leurs communautés biologiques, qui doivent s’adapter à ces conditions particulières. 

Il parait donc opportun de croiser ces connaissances scientifiques et les résultats obtenus sur ces cours d’eau suivis depuis des années avec des méthodes « classiques » dans le cadre de réseaux, pour avancer sur la connaissance de ces milieux et ouvrir des pistes d’adaptation des principes d’évaluation de l’état des milieux (indicateurs, métriques adaptées…), voire des modalités de suivi.

Mission

L’objectif du stage est, à partir des données recueillies depuis 2007, d’établir un état des lieux des stations présentant des assecs, à l’échelle régionale, d’analyser les données biologiques recueillies dans le cadre des réseaux de suivi mis en œuvre en application de la DCE, en comparant les résultats des stations de ces cours d’eau « intermittents » avec des cours d’eau permanents dans des types écologiques comparables par ailleurs (HER-rang, types et niveau de pressions). 

Activités principales

Il s’agira plus précisément :

• d’identifier et caractériser les cours d’eau / portions de cours d’eau intermittents à l’échelle de la région AURA ; 
• d’extraire et d’analyser les résultats des suivis biologiques, au niveau des indices/métriques mais aussi et surtout à l’échelle des communautés biologiques ; en focalisant prioritairement sur les communautés d’invertébrés aquatiques généralement les plus fréquemment suivies. Une comparaison des résultats de différents indicateurs pourra néanmoins être envisagée (poissons, diatomées, macrophytes) ; 
• au moins sur certaines stations pour lesquelles l’information serait disponible, de croiser les résultats biologiques avec des descripteurs de l’hydrologie, en particulier le débit lors de l’échantillonnage. 

Les analyses seront réalisées sur une double approche spatiale (comparaison de groupes de stations en fonction de leur régime hydrologique notamment) et temporelle (variations pouvant être expliquées par le régime, la date d’échantillonnage ou d’autres facteurs…).

Après réalisation d’une analyse bibliographique sur les suivis biologiques, les régimes hydrologiques et le fonctionnement des cours d’eau intermittents, il s’agira à l’échelle de la région Auvergne-Rhône-Alpes :

• 1/ De décrire les stations de suivis DCE selon la typologie générale, les pressions et les caractériser du point de vue de l’hydrologie/intermittence ;
• 2/ D’extraire, compiler et organiser les données, en priorité les suivis « invertébrés » ;
• 3/ D’analyser les variations spatio-temporelles des communautés en lien avec les caractéristiques typologiques, leur degré d’intermittence et la date d’échantillonnage ;
• 4/ De rédiger un rapport de synthèse sur ce travail.

Positionnement hiérarchique : Sous l’autorité de la Direction Régionale AuRA.

Conditions d’emploi : Stage de 4 à 6 mois mois à pourvoir pour l’obtention d'un Master 2 (niveau de diplôme visé).

Conditions d'exercice / sujétions particulières

Le/la stagiaire sera affecté/e à l’OFB-Direction régionale - Service Connaissance et basé à Bron (69500).

Il/elle sera co encadré.e par :

• Nicolas Roset – Chef du service connaissance DR-AuRA.
• Brigitte Genin – Cheffe du laboratoire d’Hydrobiologie - Cheffe adjointe du service connaissance DR-AuRA.
• Thibault Datry – Directeur de Recherche – INRAE - RiverLy.

Profil recherché

Connaissances :

Connaissance des SIG en particulier QGIS et des outils/fonctions qui s’y rapportent.

Savoir-faire opérationnel :

• Posséder de bonnes notions d’écologie, notamment sur les milieux aquatiques, et idéalement des connaissances en hydrobiologie et/ou analyse des données ;
• Démontrer des capacités d’organisation, d’autonomie, et un intérêt pour l’analyse statistique des données ;
• Participer aux opérations de collecte et de traitement des données ;
• Maîtriser des outils de bureautique courants (Word, Power point ou équivalents) ; en particulier tableurs (Excel ou équivalent) et gestionnaires de base de données (Access ou équivalent…) ;
• Maîtriser logiciel R d’analyse/représentation des données ainsi que des principales méthodes d’analyse statistique ;

Savoir-être professionnel :

• Autonomie ;
• Capacités d’organisation ;
• Aptitude et goût avéré pour l’analyse des données ;
• Qualités d’analyse et de synthèse ;
• Aptitude à la rédaction et à l’expression orale.

Diplômes – Formation – Expérience :

Titulaire d’un master 1 (ou niveau équivalent) dans le domaine de l’environnement (avec de préférence de bonnes connaissances en hydrobiologie/bioindication) et/ou le traitement des données.

Autres :

Permis de conduire (B) souhaitable.

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