Assistant(e) Ingénieur(e) en écotoxicologie aquatique

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Type d'offre : CDD (18 mois)
Localisation : Rhône-Alpes
Société : Inrae
Date limite de candidature : 14/03/2026 (publiée le 02/03/2026)

Présentation de l'offre

Vous serez accueilli(e) au sein de l'unité de recherche interdisciplinaire sur les hydrosystèmes « RiverLy , dans l'équipe « Ecotoxicologie »( https://www6.ara.inrae.fr/lyon-riverly-ecotox), dont les locaux sont situés à Villeurbanne. Les activités de l'assistant ingénieur se feront en collaboration étroite avec le laboratoire Biomae, dans le cadre du contrat de laboratoire partenarial associé entre INRAE et Biomae. L'équipe « Ecotoxicologie » est reconnue pour ses travaux dans le domaine de l'écotoxicologie aquatique animale et de la biosurveillance, aussi bien dans la sphère académique (ex : GDR Ecotox Aquatique, 5 ANR sur les 10 dernières années) que dans la sphère opérationnelle (ex : Agences de l'eau, Office Français de la biodiversité ). Les recherches de l’équipe traitent diverses questions sur 1 - le transfert des contaminants chimiques dans le biote ; 2 – l’évaluation et la compréhension de la toxicité chronique des contaminants à l’aide d’approches physiologiques (bioessais) et moléculaires (génomique, transcriptomique, protéomique, lipidomique); 3 – l’examen des différences de sensibilité aux contaminants  entre populations et entre espèces (e.g. exposition long terme, adaptation,…) ; 4 – l’évaluation des liens entre pressions chimiques au sein des cours d’eau et impacts écotoxicologiques. L’équipe est notamment reconnue pour avoir poussé  le développment de bioessais basés sur l’utilisation d’espèces européennes, présentes dans nos cours d’eau, ainsi que sur des référentiels permettant d’intégrer l’effet des facteurs physico-chimiques, autres que les contaminants, sur les réponses biologiques utilisées comme marqueurs de toxicité. Cette démarche est devenue incontournable dans l’évaluation du danger des rejets et leur impact sur les milieux aquatiques.

Contexte scientifique de l’offre :

L’offre de poste s’inscrit dans le cadre d’un projet financé par l'agence de l'eau RMC. Ce projet vise à revisiter et optimiser les méthodologies utilisées pour la mise en place des biotests in situ chez le gammare Gammarus fossarum, notamment le test d'alimentation et de reproduction. Les méthodologies développées initiallement par le laboratoire d'écotoxicologie de INRAE Lyon et transférées à Biomae répondaient à certaines contraintes, comme la source de nourriture utilisée. Les récents travaux menés en collaboration entre INRAE et Biomae offrent aujourd'hui la possibilité de repenser et simlplifier les méthodologies utilisées, visant d'une part à réduire le nombre d'organismes utilisés lors des biotests et d'autre part augmenter la sensibilité de ces biotests. 

Les activités du candidat seront principalement focalisées sur le développement de nouvelles méthodologies pour évaluer l'impact des milieux sur le taux d'alimentation et la reproduction des gammares. Le candidat sera attendu sur i) le suivi de l'avancement des travaux à réaliser dans le cadre du projet et de leur mise en place en lien avec les équipes du laboratoire d'écotoxicologie et de Biomae et ii) la mise en forme et la restitution des résultats issus de ces travaux, via la mise en place de réunion et l'écriture de rapport :

• l'organisation et le suivi des expérimentations à mettre en place pour répondre aux objectifs du projet, en collaboration avec les deux équipes impliquées
• définition de nouvelles méthodologies de biotest pour la mesure du taux d'alimentation et de la reproduction chez le gamamre et de les valider en laboratoire à l'aide de deux ou trois contaminants modèles. 
• proposer et définir une nouvelle stratégie pour l'encagement de gammare sur le terrain, permettant d'intégrer les nouvelles méthodes de biotest validées en laboratoire et de réduire de moitié les volumes des systèmes d'encagement actuels.
• faire la preuve de concept et valider ces nouvelles méthodes de biotest in situ sur le terrain, en menant une camapgne d'encagement. Cette campagne se fera faite en parallèle des campagnes programmées par l'agence de l'eau et réalisées par Biomae.

Profil recherché

• BTS/DUT (Bac+2)
• Ecotoxicologie aquatique et biologie animale.
• biotests aquatiques
• organisation, logistique, mission terrain
• Relation d’équipe, Gestion de données

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