Mise au point et expérimentation d’un protocole de suivi des communautés biologiques pour l’évaluation des effets de la restauration en petits plans d’eau

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Type d'offre : Stage (6 mois)
Localisation : Provence-Alpes-Côte d'Azur
Société : Inrae
Date limite de candidature : 15/12/2024 (publiée le 17/11/2024)

Présentation de l'offre

Contexte

Les petits plans d’eau d’origine artificielle sont issus de diverses activités humaines. Par exemple, les gravières sont des milieux aquatiques créés par les activités d’extractions de granulats et autres matériaux alluvionnaires alors que les étangs qui ont souvent une origine anthropique plus ancienne ont été creusés et aménagés pour des activités de production piscicoles. Largement anthropisés, ils sont souvent peu biogènes de par leur constitution (berges abruptes, fonds homogènes liés aux
travaux d’extraction et de creusement, forte eutrophisation). Ils représentent pourtant des écosystèmes potentiellement attractifs pour les espèces inféodées aux petits plans d’eau, dont les représentants naturels sont de moins en moins nombreux. Par ailleurs, une fois l’exploitation terminée, il est possible d’aménager ces plans d’eau, par des travaux de reprofilage de berges, de recharge sédimentaire, de replantations. Ces aménagements ont pour ambition de rendre les milieux plus biogènes et de favoriser l’installation d’une biocénose diversifiée.

D’autre part, depuis quelques années, portée notamment par les politiques européennes (Directive cadre sur l’eau, Directive Habitat, tout nouveau Règlement européen pour la restauration de la nature par exemple), une volonté de restaurer ou d’améliorer la qualité des milieux aquatiques a émergé, menant à la mise en oeuvre d’actions très diverses. Certaines d’entre elles visent spécifiquement l’amélioration des habitats, mais leurs effets réels sur les milieux restent mal connus. En effet, les actions demeurent mal recensées et peu suivies.

Afin de pallier ce manque de connaissances, le Pôle R&D ECLA « Ecosystèmes Lacustres » met en place un réseau national de sites de démonstrations pour la restauration hydromorphologique en plans d’eau (SDD), initié en 2016. Ce réseau vise à harmoniser les suivis de travaux de restauration et de diversification des habitats en plans d’eau en proposant une méthode standardisée de suivi, applicable sur l’ensemble du territoire métropolitain, selon des principes BACI et sur plusieurs années (https://professionnels.ofb.fr/fr/node/635). L’objectif est d’évaluer l’efficacité des actions mises en oeuvre en étudiant les trajectoires d’évolution des systèmes restaurés. Les milieux d’étude sont les plans d’eau, naturels ou artificiels, d’une superficie de 2 hectares minimum. Un guide opérationnel, présentant la méthodologie et les protocoles associés, a été publié en 2019. Ce guide est une première proposition et a vocation à s’enrichir des retours d’expériences pour améliorer la qualité du suivi proposé et sa capacité à mesurer l’atteinte des objectifs de restauration.

En particulier, l’un des fondements du réseau SDD est de préconiser la mise en oeuvre de protocoles standardisés, reproductibles et présentant un coût acceptable, permettant d’être mis en oeuvre par toute structure ayant la compétence. C’est pourquoi les protocoles proposés se basent largement sur ceux utilisés dans le cadre de la surveillance DCE. Par exemple, concernant les suivis des communautés benthiques et macrophytiques, il s’agit d’adaptations des protocoles IBML (Indice Biologique Macrophytique Lacustre) d’après la Norme Française T90-328 (AFNOR, 2022) et IML (Indice Macroinvertébrés Lacustres) par Dedieu et Verneaux (Nicolas Dedieu & Valérie Verneaux, 2022 : Guide technique de l’IML).

Cette volonté forte pose toutefois quelque s questions. En particulier, il s’agit de savoir si les données issues de ces protocoles de collecte sont suffisamment pertinentes pour répondre aux objectifs du suivi de la restauration.
Par ailleurs, les masses d’eau suivies dans le cadre de la surveillance DCE sont des plans d’eau d’au moins 50 hectares. Les protocoles développés dans ce cadre ont été construits en incluant ce critère de taille, et leur adaptation à des plans d’eau de plus petite taille doit être investiguée.

Indépendamment de ce projet, le laboratoire LIVE mène depuis plusieurs années des expérimentations sur une zone humide restaurée par la Collectivité Européenne d’Alsace, sur le site du Woerr (67). Ces expérimentations visent la restauration ou la recréation de petits milieux lentiques, et portent un intérêt particulier à la limitation du développement des espèces exotiques sur ces nouveaux milieux. Pour suivre les évolutions des mesures mises en oeuvre, le laboratoire a, entre autres, fait le choix d’appliquer la méthode BECOME, développée spécifiquement pour les petits plans d’eau par le bureau d’études Aquabio. Le laboratoire entretient des liens forts avec les gestionnaires de milieux aquatiques en Alsace, et d’autres sites pourraient faire l’objet de suivis prochainement. Un premier stage, réalisé en 2024, a consisté à mettre en oeuvre et à comparer ces deux protocoles de suivi, le protocole développé par le Pôle ECLA et le protocole BECOME, sur deux plans d’eau de petite taille (gravière du Woerr et gravière de Portet-sur-Garonne). Ce stage a permis de montrer une certaine complémentarité des données obtenues par les deux protocoles et l’analyse qu’il est possible d’en tirer. Aussi, il s’agit de poursuivre ces travaux en élaborant un nouveau protocole combinant les deux protocoles testés, et de l’expérimenter sur deux nouveaux petits plans d’eau. Comme pour 2024, un site sera choisi parmi les sites du réseau SDD, et le second parmi les sites sur lesquels le laboratoire LIVE a des projets d’études.

Objectifs

Après une réflexion bibliographique préalable, l’objectif de ce stage sera :

• De mettre au point un protocole expérimental de suivi des communautés macrophytiques et macro-invertébrées pour l’évaluation des effets des opérations de restauration, en se basant sur les protocoles existants ;
• De mettre en oeuvre ce protocole expérimental sur deux plans d’eau avec l’équipe encadrante, depuis la phase terrain jusqu’à la saisie des données, en passant par la détermination ;
• De quantifier précisément les éléments de coûts et de mise en oeuvre pour ce nouveau protocole, par rapport aux éléments apportés ;
• D’analyser les résultats issus de ce stage ainsi que du précédent pour mieux connaître les effets de la restauration des petits plans d’eau sur les communautés étudiées.

Profil recherché

• Formation Master 2 en écologie avec une spécialité milieux aquatique et/ou restauration des écosystèmes ;
• Expérience en détermination des macrophytes, ou à défaut des communautés végétales terrestres
• Connaissances générales sur le fonctionnement des écosystèmes d’eau douce ;
• Connaissance des macroinvertébrés benthiques. Une expérience dans le tri/la détermination serait un plus ;
• Intérêt pour le travail de terrain ;
• Maitrise des outils informatiques, de bureautique (pack Office) ;
• Compétences en analyse de données et SIG, notamment via les logiciels R et Q GIS ;
• Capacité à appréhender un projet de recherche scientifique. Une expérience précédente lors d’un stage, d’un projet tutoré ou une forte motivation pour ce domaine, est demandée.
• Dynamisme, enthousiasme, curiosité, rigueur, patience et sérieux ;
• Aptitude au travail de terrain, de laboratoire et en équipe tout en ayant un esprit d’initiative et un minimum d’autonomie ;
• Le stage impliquant un travail sur plusieurs sites expérimentaux et laboratoires en France, une forte adaptablité est demandée
• Permis B.

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