Etude des tendances temporelles de la qualité écologique des rivières occitanes à travers l’analyse de bioindicateurs aquatiques H/F

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Type d'offre : Stage (6 mois)
Localisation : Midi-Pyrénées
Société : Office Français de la Biodiversité (OFB)
Date limite de candidature : 12/02/2026 (publiée le 12/01/2026)

Présentation de l'offre

L’objectif de ce stage sera d’étudier les évolutions temporelles de la qualité écologique des rivières occitanes au travers des sites faisant partie du réseau de référence pérenne (RRP) et du réseau de contrôle de surveillance (RCS). 
    
Cette évaluation sera réalisée en priorité sur les 3 compartiments biologiques sur lesquels travaille le laboratoire d’hydrobiologie : les diatomées, les macro-invertébrés et les macrophytes. 

Activités principales :

Le stagiaire aura pour principales missions, sur le volet RRP ainsi que le volet RCS de : 

• Construire un jeu de données regroupant les données de tous les compartiments biologiques
• Réaliser des analyses statistiques via R pour mettre en évidence les potentielles évolutions des indicateurs/données biologiques dans le temps
• Interpréter ces évolutions et identifier les facteurs qui en sont responsables avec l’aide des agents du laboratoire d’hydrobiologie

Pour les sites faisant partie du RRP, il sera également demandé la réalisation d’un rapport automatisé, pouvant être mis à jour annuellement de façon simple. Ce que l’on appelle « automatisation » est la génération d’un rapport automatique sous format word via Rmardown et qui regroupera les différents graphiques ou tableaux qui permettront de visualiser les données. Une procédure détaillée du fonctionnement de l'outil d'automatisation devra être rédigée pour faciliter la mise à jour annuelle du rapport.

L’intégration des données piscicoles et hydromorphologiques à l’analyse sera envisagée et réalisée dans la mesure du possible. 

Le ou la stagiaire sera basé.e sur le site du laboratoire d’hydrobiologie à Toulouse. Des déplacements fréquents seront à prévoir sur le site de Montpellier. 

Il ou elle pourra également être amené.e à accompagner les agents du laboratoire sur le terrain pour la réalisation d’inventaires. 

Lieu d'affectation

Le laboratoire d’hydrobiologie a été intégré au service connaissance de la direction régionale Occitanie de l’OFB en 2023. Il réalise des prélèvements et déterminations faunistiques (invertébrés benthiques) et floristiques (diatomées et macrophytes) des cours d’eau dans le cadre des réseaux de suivi du programme de surveillance des masses d’eau, en partenariat avec les Agences de l'Eau. Ce programme de surveillance découle de la mise en œuvre de la Directive cadre sur l’Eau, directive européenne qui définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grands bassins hydrographiques sur le plan européen. Cette directive fixe des objectifs ambitieux pour la préservation et la restauration de l’état des eaux superficielles (eaux douces et eaux côtières) et pour les eaux souterraines.

Parmi les réseaux du programme de surveillance des masses d’eau, on retrouve : 

• Le réseau de référence pérenne (RRP) : il a pour but de consolider la connaissance et l’évolution des conditions rencontrées dans des milieux épargnés au mieux par les activités humaines, dans un contexte de changement climatique.
• Le réseau de contrôle de surveillance (RCS) : il permet d’évaluer l’état général des eaux et les tendances d’évolution au niveau d’un bassin. 

Les inventaires floristiques et faunistiques sur les sites qui font partie de ces deux réseaux participent au calcul de l’état écologique nécessaire au processus d’évaluation de l’état des masses d’eau.  

Localisation du poste

Toulouse, Haute-Garonne

Début du contrat

Mars 2026

Durée du contrat

Durée fixe, 6 Mois

Profil recherché

Connaissances :

• Fonctionnement des écosystèmes aquatiques (habitat, biodiversité…)

Savoir-faire opérationnel :

• Langage de programmation R et utilisation courante de QGIS, une expérience dans la pratique de Rmardown serait un plus
• Analyser des données et synthétiser
• Bonnes compétences rédactionnelles

Savoir-être professionnel :

• Curiosité & motivation
• Un bon sens du relationnel
• Capacité d’autonomie, de rigueur, et sens de l’organisation

Diplômes – Formation – Expérience :

Etudiant.e en Master 2 ou dernière année d’école d’ingénieur (écologie, biodiversité, spécialités statistiques)

Autres :

• Permis de conduire catégorie B souhaité

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